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动物检疫可分进出口检疫和国内检疫2大类。动物进出口检疫指进口或出口的家畜及其产品以及观赏动物和野生动物等在到达国境界域时所受到的检疫。国内检疫可分产地检疫和运输检疫。前者如集市或牲畜市场检疫，或产地收购检疫，是在贸易过程中进行的。目的在于避免屠宰病畜、散布病原，造成非病区传染；后者指交通运输部门对托运的动物及其产品进行检疫，检查产地签发的检疫证书，准予或不准予托运。此外，尚有国际邮包检疫和过境检疫等。