目的:通过转录组测序（RNA-seq）分析小檗碱对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌USA300基因组表达谱的影响，研究小檗碱对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）的抑菌机制。方法:基础研究。本研究使用标准菌株USA300，该菌株为中科院上海药物所蓝乐夫课题组2019年所赠送。用1/2最低抑菌浓度（MIC）（64 mg/L）和1/8MIC（16 mg/L）浓度的小檗碱处理和无小檗碱处理耐甲氧西林金黄色葡萄球菌USA300，分析USA300差异基因表达情况。将差异基因筛选条件设为：n P值2。采用SPSS 20.0进行统计分析。n 结果:通过测序结果发现，高浓度组与正常对照组相比，共有754个差异基因表达，其中上调基因主要为lukD、lukE、ssaA等，下调基因主要为lukF-PV、lukS-PV、clfA、splB~splF、sspA等；低浓度组与正常对照组相比，仅有19个差异基因表达，其中上调基因为speG、scpB、rpsQ等，下调基因为betA、bccT等。结论:本研究USA300转录组基因表达情况，了解经小檗碱作用后差异基因表达情况，推测小檗碱主要通过调控细菌细胞壁水解功能、白细胞毒素及其他毒力因子的表达发挥对MRSA的抑菌作用。