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硒蛋白是硒以氨基酸－硒半胱氨酸的形式存在的蛋白质。硒半胱氨酸有自己独特的ｔＲＮＡ和ＵＧＡ密码子。硒半胱氨酸的合成发生在它的ｔＲＮＡ上。ＵＧＡ作为硒半胱氨酸的密码子在自然界是通用的。ｔＲＮＡ的转录由ＲＮＡ聚合酶Ⅲ催化，还有特异的外部启动子，ＴＡＴＡｂｏｘ和近端序列元件。硒交胱氨酸参入到蛋白质中需要硒半胱氨酸插入顺序元件和特殊的延长因子。