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新型农村合作医疗采取农民个人缴费、集体扶持、政府资助相结合的筹资办法。安吉县采用“三级筹资、一级管理”的办法，即省财政、县乡（镇）两级财政、农民个人三级筹资、由县统一管理。对低保及优抚对象、独生子女的父母、残疾人，县财政和县残联重点倾斜补助筹资资金。对合作医疗基金科学测算，切块使用，分类补偿。一般基金总额的60％～70％用于大额医疗费用补偿，20％～30％用于门诊常见病、多发病及特殊病种的补偿，10％提取用于风险储备基金。