可变剪切事件在胰腺癌中的发生及其临床意义

来源 :疑难病杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：GAODAOQUAN

【摘要】

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目的探索胰腺癌(PAAD)中存在的差异RNA剪接模式,分析可变剪切(AS)事件与胰腺癌临床预后的关系。方法自癌症基因组图谱(TCGA)中下载RNA-seq数据、临床数据资料,提取剪接因子(S

【作者】

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帕成周张贯启邬善敏

【机构】

：

武汉大学人民医院肝胆外科

【出处】

：

疑难病杂志

【发表日期】

：

2020年2期

【关键词】

：

胰腺癌可变剪切癌症基因组图谱剪接因子预后 Pancreatic adenocarcinomaAlternative splicingTCGASplici

【基金项目】

：

武汉市科技计划项目(201161038342-02)

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目的探索胰腺癌(PAAD)中存在的差异RNA剪接模式,分析可变剪切(AS)事件与胰腺癌临床预后的关系。方法自癌症基因组图谱(TCGA)中下载RNA-seq数据、临床数据资料,提取剪接因子(SF)表达量;采用TCGA SpliceSeq工具下载提取AS事件数据,评估7种可变剪切类型在胰腺癌病例中的发生情况;采用Kaplan-Meier分析及Cox回归分析评估AS事件风险值和生存时间之间的相关性,并探索PAAD的独立危险因素;采用Cytoscape构建基于生存相关的AS事件与SF的调控关系网络。结果PAAD中

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