【摘 要】
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【目的】挖掘并鉴定油棕生长素上调小RNA（SAUR）基因家族成员，并对其进行生物信息学分析，为油棕生长素信号转导机制的研究提供参考。【方法】根据拟南芥SAUR基因序列，在油棕全基因组数据库中同源序列搜索，并利用CDD和Pfam数据库进行SAUR蛋白结构域分析，剔除无保守结构域的序列，最后利用生物信息学软件对油棕SAUR基因家族成员进行可视化分析。【结果】从油棕全基因组中共鉴定出40个SAUR基因家
【机 构】
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中国热带农业科学院椰子研究所/海南省热带油料作物生物学重点实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金项目（31870670）～～；
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【目的】挖掘并鉴定油棕生长素上调小RNA（SAUR）基因家族成员，并对其进行生物信息学分析，为油棕生长素信号转导机制的研究提供参考。【方法】根据拟南芥SAUR基因序列，在油棕全基因组数据库中同源序列搜索，并利用CDD和Pfam数据库进行SAUR蛋白结构域分析，剔除无保守结构域的序列，最后利用生物信息学软件对油棕SAUR基因家族成员进行可视化分析。【结果】从油棕全基因组中共鉴定出40个SAUR基因家族成员（EgSAUR1～EgSAUR40），有31个基因在油棕14条染色体上呈不均匀分布，其中4号染色体上分布的基因最多为7个；除EgSAUR14和EgSAUR24基因含有2个外显子外，其余38个基因均仅含1个外显子，无内含子。40个EgSAURs蛋白亚细胞定位于细胞核，其二级结构均由α-螺旋、β-转角、无规卷曲和延伸链组成，以无规卷曲和α-螺旋所占比例较高，其中有11个EgSAURs蛋白呈酸性，29个EgSAURs蛋白呈碱性。40个油棕SAUR蛋白被划分为四大类，其中第Ⅰ（除EgSAUR27蛋白外）、Ⅱ（除EgSAUR3和EgSAUR22外）、Ⅲ、Ⅳ类蛋白均有Auxin＿inducible保守结构域。40个EgSAURs蛋白共含10种保守基序（Motif），其中Motif 2存在于所有基因成员中。在花中特异表达的EgSAURs基因（EgSAUR4、EgSAUR9、EgSAUR10、EgSAUR24、EgSAUR29、EgSAUR30、EgSAUR32和EgSAUR33）数量最多，其次为根、茎和叶，在中果皮中特异表达的基因数最少。【结论】基因重复和组织表达特异性是油棕SAUR家族基因的两大特点，推测该家族基因对油棕花的生长发育及授粉受精过程发挥调控作用。
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