目的探讨2009年杭州市甲型H1N1流感的流行规律、临床表现和病原学特征。方法对2009年杭州市13家流感监测哨点医院的每日门诊流感样病例和甲型H1N1流感确诊病例的流行病学进行分析。采用RT—PCR方法对咽拭子中血凝素（HA）基因进行扩增和测序，并用DNASTAR软件进行序列分析。全文数据采用SPSS12．0软件进行统计分析，率的比较采用χ^2检验。结果流感样病例监测显示，第28周之前，疫情处于平稳状态，之后全市流感样病例逐渐增多。第35周时达到高峰，全市流感样病例就诊比例为7．47％（5442／72859）。之后疫情回落，但到第41周时又再次回升，至第46周出现第二次高峰，全市流感样病例就诊比例达到11．32％（11034／97436）。第38周以前，杭州市人群中主要流行株是季节性H1N1型，其次有少量的乙型和季节性流感H1N1型，到第44周，甲型H1N1流感成为唯一的优势流行株，主要易感人群是11～25岁的青少年，以学生居多。序列分析显示，2009年杭州市甲型H1N1流感病毒株与北美株、中国其他地区的毒株以及疫苗株同源性达到99％，关键位点高度保守，但与季节性流感病毒株同源性只有70％。结论2009年杭州市流感疫情发展迅速，人群中流行的优势毒株为甲型流感H1N1型，易感人群为青少年，目前未发现变异株及高致病株，但仍需进一步监测。