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类胡萝卜素合成酶基因（crt基因）是一类指导类胡萝卜素合成的基因，迄今为止还没有人很好地阐述蓝藻crt基因序列的多样性和早期进化特征．为研究蓝藻crt基因的多样化程度，了解其进化规律，文中利用现有资料，分析了参与蓝藻门中类胡萝卜素代谢的关键酶的分子进化关系，主要目的是提供crt基因在蓝藻门中的进化轮廓，分析其是否存在基因的水平转移，并评价其选择方式，便于今后描述该基因在蓝藻中的进化特征．系统发育分析发现在蓝藻基因组中频繁发生基因的水平转移，而氨基酸变化大部分是在正向选择下进化的．分析还发现大部分代谢前期的