应用基因芯片分析甘蓝型油菜柱头特异表达基因

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以甘蓝型油菜(Brassica napus)野生型(宁油10号)及其柱头授粉功能缺失突变体FS-M1为材料,使用油菜基因表达谱芯片筛选甘蓝型油菜柱头特异表达基因。在含有16 540个基因的油菜基因表达谱芯片中(43 803探针),获得了4 410条差异表达探针,选择部分差异表达基因进行实时定量PCR,所得结果与芯片检测结果相吻合。其中,野生型较FS-M1显著上调且获得209个功能注释的探针,对应198个基因,这些特异表达的基因主要富集在水解酶、转移酶、氧化还原酶和转录因子中;涉及较大的基因家族包括:细胞色素P450基因、GDSL脂肪酶/水解酶基因、ABC转运蛋白基因、myb转录因子基因、bHLH转录因子基因、过氧化物酶家族和受体激酶基因等。推测这些基因与甘蓝型油菜柱头发育及授粉功能有关。 The Brassica napus wild type (Ningyou 10) and its stigma pollination-deficient mutant FS-M1 were used as materials to screen the stigma-specific gene of Brassica napus using rape gene expression profiling. A total of 4410 differentially expressed probes were obtained from 43 803 probes containing 16 540 genes, and some differentially expressed genes were selected for real-time quantitative PCR. The results were in good agreement with the results of microarray analysis. Among them, the wild-type was significantly up-regulated compared with FS-M1 and 209 functional annotated probes were obtained, corresponding to 198 genes. These specifically expressed genes were mainly concentrated in hydrolases, transferases, oxidoreductases and transcription factors; Large gene families include: cytochrome P450 gene, GDSL lipase / hydrolase gene, ABC transporter gene, myb transcription factor gene, bHLH transcription factor gene, peroxidase family and receptor kinase gene. It is speculated that these genes are related to stigma development and pollination of Brassica napus.
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