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EST是对cDNA文库随机挑取的克隆进行大规模测序获得的序列,长度一般为150～500bp。EST携带信息量较大,含有潜在的表达序列信息,与一些已知和未知的功能基因连锁。EST中SSR结构及分布广,不仅可以存在与内含子,也存在于编码区、非编码区和调控区,数量庞大的SSR在基因组中分布均匀,可代表整个基因组。综述了EST-SSR标记的开发过程及在动物及动物寄生虫上的应用。