目的比较荧光定量PCR法和传统细菌培养药敏试验两种方法鉴定耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的能力,评估荧光定量PCR直接检测不同类型标本中MRSA的mecA基因是否具有临床应用价值。方法收集2013年11月-2014年11月经细菌培养和纸片药敏试验确定为金黄色葡萄球菌的111份临床标本,荧光定量PCR法检测标本的mecA基因,比较两种方法结果。结果两种方法具有较好一致性、吻合度,差异有统计学意义;以传统方法为对照,荧光定量PCR直接检出MRSA的敏感性为100.0%、特异性90.9%;PCR检出痰液标本的MRSA的敏感性为100.0%、特异性100.0%;PCR检出其他标本的MRSA的敏感性为100.0%、特异性81.8%;mecA基因直接检测与传统方法不一致的全部为血培养标本,但分离菌落基因检测与药敏结果一致。结论荧光定量PCR直接检测临床标本mecA基因用于筛查MRSA可靠,临床微生物实验室可推广以早期控制医院感染和指导临床抗菌药物使用。