【摘 要】
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水产动物种质资源保存和管理工作中需要分析基因组亲缘关系及近交水平,为此开发了一套水产动物基因组近交分析软件工具包。该软件工具包从高通量基因分型数据预处理起始,以多种统计基因组学分析方法解析、呈现群体遗传特征,提供如基因组共祖系数(Genomic coancestry coefficient)、显性亲缘关系(Dominance coefficient)、血缘同源(Identity by descent,IBD)、状态同源(identical by state,IBS)、基因组近交系数(Genomic inb
【机 构】
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中国水产科学研究院黑龙江水产研究所
【基金项目】
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农业财政专项经费项目“西北地区重点水域渔业资源与环境调查”,中国水产科学研究院基本科研业务费(2019XT0605、2020TD22),淡水鱼类育种国家地方联合实验室开放课题(HSY201913K1-2).
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水产动物种质资源保存和管理工作中需要分析基因组亲缘关系及近交水平,为此开发了一套水产动物基因组近交分析软件工具包。该软件工具包从高通量基因分型数据预处理起始,以多种统计基因组学分析方法解析、呈现群体遗传特征,提供如基因组共祖系数(Genomic coancestry coefficient)、显性亲缘关系(Dominance coefficient)、血缘同源(Identity by descent,IBD)、状态同源(identical by state,IBS)、基因组近交系数(Genomic inb
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