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采用AFLP（Amplified fragmentlength polymorphism）技术分析了来自四川14个不同水稻种植区和50个不同籼型杂交稻稻曲病菌（Ustilaginoidea virens）的遗传多样性。20对选择性扩增EcoRⅠ和MseⅠ引物组合稻曲病菌株可产生40～56条DNA带,75个菌株共产生192条清晰可见的DNA带型,其中多态性121条,占总数的63.02%。结果表明：不同地理来源稻曲病菌可能具有相同的遗传群体结构,也显示特异性的群体遗传特征;稻曲病菌遗传结构与寄主品种关系不大,