茶树SBP-box转录因子的比较基因组学与遗传分析

来源 :西北植物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qinsikai
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SQUAMOSA启动子结合蛋白(SBP-box)是植物特异性转录因子,在植物生长发育中发挥重要作用.该研究利用生物信息学分析方法,对不同\'铁观音\'、\'黄棪\'、\'舒茶早\'和\'龙井43\'茶树基因组的SBP基因进行鉴定和比较,通过qRT-PCR技术分析CsTGY_SBP家族成员在不同茶树品种中的表达模式,为探究SBP基因在茶树杂种和亲本上的遗传规律提供参考.结果显示:(1)在茶树品种\'铁观音\'、\'黄棪\'、\'舒茶早\'和\'龙井43\'基因组中分别鉴定出21个、25个、24个和23个SBP家族基因.(2)系统进化树将其分为8个亚家族,共线性分析发现茶树和拟南芥、葡萄的SBP基因共线性关系与水稻相比更强,同物种内发现\'铁观音\'与\'黄棪\'的共线性关系更显著.(3)qRT-PCR结果表明,CsTGY_SBP5、CsTGY_SBP9和CsTGY_SBP14在F1\'金观音\'中呈中亲表达的模式;大部分CsTGY_SBPs基因在F1\'黄观音\'呈低于双亲表达模式,CsTGY_SBP5和CsTGY_SBP8在F1\'金牡丹\'中显著高于亲本;CsTGY_SBP5、CsTGY_SBP7、CsTGY_SBP12、CsTGY_SBP16和CsTGY_SBP18在F1\'紫玫瑰\'中的表达量显著高于亲本,呈超高亲表达的模式;CsTGY_SBPs基因在F1\'紫牡丹\'中整体表达趋于亲本铁观音,在F1\'瑞香\'中整体呈现低于亲本\'黄棪\'的表达模式.研究表明,CsTGY_SBP5在F1\'金牡丹\'和F1\'紫玫瑰\'中的表达均显著高于亲本,推测CsTGY_SBP5可能是茶树杂种优势的重要调控因子.
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