2013年太原市迎泽区水痘-带状疱疹病毒基因型分析

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目的分析太原市迎泽区2013年引发水痘疫情的水痘-带状疱疹病毒(VZV)流行株的基因型别,为预防控制水痘疫情提供依据。方法收集23份水痘患儿的临床标本。实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)鉴定是否为VZV核酸阳性。PCR扩增447 bp大小的部分开放阅读框(ORF)22片段,并测序。用Vector NTI Suite 6和Clustalx软件分析核酸序列并与参考菌株进行聚类分析。结果 19份临床标本鉴定为VZV野毒株核酸阳性,其中有12份标本的PCR产物在约447 bp处有明显的特异性条带。12条VZV的447 bp片段核酸序列的6个单核苷酸多态性关键位点与J基因型参考株完全一致。结论太原市迎泽区2013年引发水痘疫情的VZV主要流行株为J基因型野毒株。
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