棉花水通道蛋白序列生物信息学初步分析

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水通道蛋白(aquaporin,AQP)是高效转运水分子的膜内在蛋白,在调控植物的水分关系中有重要作用,和抗旱性能紧密相关。为初步评价分析棉花AQP序列资源,对网上最新且仅有的52条棉花AQP序列进行分子聚类,同时将其进行多序列比对及亚细胞定位,结果表明:棉花AQP大致分为7类,具有丰富的多样性,AQP基因在跨膜转运以及光合中起重要作用。另外,来自水稻、大豆、玉米、拟南芥的328条AQP序列和52条棉花AQP序进行分子聚类,结果表明:有48条棉花AQP和大豆聚为一类,遗传距离较接近。
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