目的:通过16Sr RNA高通量测序研究高龋均和重度牙周炎患者的唾液中微生物群落组成情况及其差异性。方法:随机选取高龋均和重度牙周炎患者各10例,分别采集每个患者的唾液样本并提取各样本中的微生物总DNA后,用PCR扩增其16Sr RNA序列的V3+V4区,同时对合格的DNA样本进行高通量测序。结果:从高龋均和重度牙周炎患者的唾液微生物群落中筛选获得733 104条优质序列,共检测到386个操作分类单元(OTUs),分别归为14个门、23个纲、39个目、59个科、98个属。菌门和菌属分析结果显示,两组患者唾液中的微生物群落结构有差异性;菌门水平上,厚壁菌门在高龋均组的丰度高于重度牙周炎组,拟杆菌门、螺旋体门在重度牙周炎组的丰度高于高龋均组(P<0.05);菌属水平上,链球菌属、孪生球菌属在高龋均组的丰度高于重度牙周炎组,奈瑟氏菌属、普氏菌属-7、普氏菌属在重度牙周炎组的丰度高于高龋均组(P<0.05)。结论:高龋均和重度牙周炎患者唾液中的微生物群落结构存在差异性,其中以高龋均患者的微生物群落结构更多样。