基于生物信息学的CDK1在肺腺癌中的表达及其意义

来源 :中国胸心血管外科临床杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liugang
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目的 通过生物信息学方法分析细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)在肺腺癌中的表达及其临床意义。方法 基于TCGA中肺腺癌患者基因表达数据分析CDK1在肺腺癌组织和正常肺组织差异表达情况,使用UALCAN分析肺腺癌中CDK1基因在不同角度下的表达差异。利用Kaplan-Meier Plotter进行肺腺癌中CDK1基因高低表达组不同情况下的生存分析。基于TCGA中肺腺癌临床数据进行CDK1表达量与总生存期的相关性Cox分析。对临床病例中与CDK1表达相关的基因序列进行基因富集分析。经STRING获取CDK1来自智人的蛋白相互作用网络。获取CDK1相关基因蛋白,通过在线网站GEPIA进行相关分析。结果 基于对TCGA基因表达数据分析可知CDK1在肺腺癌中表达高于正常肺组织,通过UALCAN分析发现CDK1高表达与吸烟可能有一定的相关性,生存分析提示当CDK1基因高表达时,肺腺癌患者预后较差。将CDK1的表达量与总生存期进行单因素和多因素Cox回归分析示,CDK1高表达是肺腺癌患者生存期的独立风险因素。进行基因富集分析可知CDK1高表达与DNA复制、细胞周期、癌症通路、P53信号通路密切相关。结论 CDK1可能是一种潜在的肺腺癌预后相关的分子标志物,此外,DNA复制、细胞周期、癌症通路、P53信号通路可能是由肺腺癌中的CDK1调节关键的路径。
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