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依据产学研合作创新模式的特点,构建了产学研评价指标体系。选取全国医药产业2014-2016年的产学研数据,利用两阶段链式网络DEA方法对全国的产学研合作创新效率进行评价,将江苏省医药产业的产学研效率与其他地区进行比较。结果表明江苏省医药产业产学研创新整体效率不高,且知识开发阶段效率较低,主要原因在于缺少产学研专项资金、产学研信息服务平台效率低下以及产学研政策规范体系不完善等。