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大数据时代健康信息隐私安全问题的频繁出现使得整个社会的健康价值观念受到前所未有的挑战,保证公众健康信息隐私不被泄露与恶意侵犯的同时利用可访问的健康信息造福大众是大数据时代健康信息隐私管理的基本宗旨。文章通过查阅文献资料、专家走访、政府咨询的方式,对健康信息隐私内涵进行了梳理;对我国健康信息隐私管理面临的困境进行分析。最后阐述了政府应当明确自身角色的职责,突破管理困境,保障公众健康信息安全。