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目的
探讨未感染幽门螺旋杆菌(HP)的胃癌样本与感染HP的胃癌样本之间的差异。
方法提取TCGA数据库中胃癌样本基因表达量(MRNA)的数据。根据胃癌样本中有无HP感染将样本分为2组,通过edgeR算法分别对比表达量数据,并得到差异基因。再将得到的两组差异基因分别进行富集分析,最后比较两组富集分析的结果,得出未感染HP的胃癌样本与感染HP的胃癌样本之间富集通路的差异。
结果由KEGG数据库可知,未感染HP的胃癌样本在代谢途径、蛋白质消化和吸收、脂肪消化和吸收、胃酸分泌、胰腺分泌、cAMP信号通路、血管平滑肌收缩方面与癌旁比较,差异有统计学意义(P<0.000 01)。感染HP的胃癌样本在细胞因子-细胞因子受体相互作用方面与癌旁比较,差异有统计学意义(P<0.000 01)。
结论HP感染导致细胞因子-细胞因子受体相互作用异常。可能有2种不同的胃癌亚型,分别对于代谢途径、蛋白质消化和吸收、脂肪消化和吸收、胃酸分泌、胰腺分泌、cAMP信号通路、血管平滑肌收缩方面与细胞因子-细胞因子受体相互作用方面产生影响。