【摘 要】
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传统数据降维方法处理单细胞RNA测序数据存在特征提取能力较差、聚类精度较低等问题,有必要引入深度学习方法以提高对复杂数据特征的提取能力。在对数据不进行任何人工筛选的
【基金项目】
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国家自然科学基金(61902221),山东省自然科学基金(ZR2018MF012)
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传统数据降维方法处理单细胞RNA测序数据存在特征提取能力较差、聚类精度较低等问题,有必要引入深度学习方法以提高对复杂数据特征的提取能力。在对数据不进行任何人工筛选的条件下,利用DAE提取表达能力更强的数据特征,分别以K⁃means和DBSCAN聚类作为DAE的顶层设置形成DAE+K⁃means和DAE+DBSCAN组合模型,将这两种深度学习组合模型在Deng数据集上与传统聚类模型SC3进行对比。与SC3的0.73聚类精度相比,DAE+K⁃means和DAE+DBSCAN的聚类精度分别达到0.93和0.97
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