【摘 要】
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目的建立鼠类感染沙粒病毒的CODEHOP RT-PCR检测方法。方法依据沙粒病毒N蛋白氨基酸序列设计1对CODEHOP引物,建立沙粒病毒一步RT-PCR检测方法,分析该引物在对不同种沙粒病毒
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目的建立鼠类感染沙粒病毒的CODEHOP RT-PCR检测方法。方法依据沙粒病毒N蛋白氨基酸序列设计1对CODEHOP引物,建立沙粒病毒一步RT-PCR检测方法,分析该引物在对不同种沙粒病毒基因序列上的结合位点及所能获得的产物序列大小;通过检测分离自鼠类的沙粒病毒属淋巴细胞脑膜炎病毒(LCMV)株MS111013,评价方法的特异性和灵敏度;对MS111013扩增产物进行Blast同源性比对。结果从GenBank获得的22种沙粒病毒均存在CODEHOP引物结合位点,扩增产物大小在406~429bp之间。建立的CODEHOP RT-PCR方法可特异性扩增LCMV病毒核酸,目的片段大小与预期结果相符,核酸的最小检出量为11.8pg。经Blast比对,MS111013与LCMV病毒株Douglas strain(4707)同源性较高,为86%。结论建立的沙粒病毒CODEHOP RT-PCR检测方法敏感、特异,可用于鼠类沙粒病毒感染检测。
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