天津市2019年住院散发急性胃肠炎患儿中诺如病毒感染分子流行病学特征分析

来源 :中华微生物学和免疫学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:marsmoonhoo
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:了解天津市2019年散发急性胃肠炎患儿中诺如病毒(Norovirus, NoV)感染的分子流行病学特征。方法:收集2019年1—12月就诊于天津市儿童医院住院散发急性胃肠炎患儿的粪便标本3 116份,收集患儿临床资料和个人信息,采用实时荧光定量PCR方法对NoV进行初筛,应用反转录PCR方法对初筛阳性标本的聚合酶区和衣壳蛋白区进行扩增,并对序列进行比对和系统进化分析。结果:3 116份粪便标本中检出NoV阳性809份,阳性率为26.0%(809/3 116)。不同年龄组NoV检出率差异有统计学意义(n P=0.000),其中7~12月龄组检出率最高(31.6%);不同季节间NoV检出率差异有统计学意义,其中冬季为高发季节(39.0%)。序列分析发现,286份阳性标本的两个区域均测序成功,分成6个基因型,分别是GⅡ.P12-GⅡ.3,GⅡ.P16-GⅡ.2,GⅡ.P17-GⅡ.17,GⅡ.Pe-GⅡ.2,GⅡ.Pe-GⅡ.3和GⅡ.Pe-GⅡ.4。其中以GⅡ.Pe-GⅡ.4为主,占61.2%(175/286)。其次为GⅡ.P12-GⅡ.3,占33.6%(96/286);GⅡ.Pe-GⅡ.3占2.4%(7/286);GⅡ.P16-GⅡ.2占2.1% (6/286);GⅡ.Pe-GⅡ.2和GⅡ.P17-GⅡ.17均占0.3% (1/286)。GⅡ.Pe-GⅡ.4中全部为GⅡ.Pe-GⅡ.4 Sydney 2012。携带GⅡ.Pe-GⅡ.4 Sydney 2012型NoV患儿较GⅡ.P12-GⅡ.3更容易出现呕吐。n 结论:NoV是儿童病毒性急性胃肠炎的重要病原体,GⅡ.Pe-GⅡ.4 Sydney 2012和GⅡ.P12-GⅡ.3是2019年天津地区住院散发急性胃肠炎中NoV感染的主要流行株。“,”Objective:To investigate the molecular epidemiological characteristics of norovirus (NoV) in hospitalized children with sporadic acute gastroenteritis in Tianjin in 2019.Methods:Fecal specimens and clinical data were collected from 3 116 hospitalized children with sporadic acute gastroenteritis possibly caused by viral infection in Tianjin Children′ Hospital between January and December, 2019. Real-time quantitative PCR was used to detect NoV. Partial sequences of RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) and capsid genes of NoV were amplified by RT-PCR. Sequence alignment and phylogenetic analysis were performed for further analysis.Results:Among the 3 116 specimens, 809 (26.0%) were positive for NoV. There were significant differences in NoV detection rate between different age groups (n P=0.000), and the highest NoV detection rate (31.6%) was observed in the age group of 7-12 months. Moreover, the detection rate of NoV varied with seasons (n P=0.000), and the NoV detection rate was highest in winter (39.0%). Based on the sequence analysis of RdRp and capsid genes, 286 identified NoV strains belonged to six genotypes, which were GⅡ.P12-GⅡ.3, GⅡ.P16-GⅡ.2, GⅡ.P17-GⅡ.17, GⅡ.Pe-GⅡ.2, GⅡ.Pe-GⅡ.3 and GⅡ.Pe-GⅡ.4. The predominant genotype was GⅡ.Pe-GⅡ.4 Sydney 2012 (61.2%), followed by GⅡ.P12-GⅡ.3 (33.6%, 96/286), GⅡ.Pe-GⅡ.3 (2.4%, 7/286), GⅡ.P16-GⅡ.2 (2.1%, 6/286), GⅡ.Pe-GⅡ.2 (0.3%, 1/286) and GⅡ.P17-GⅡ.17 (0.3%, 1/286). Patients carrying the NoV of GⅡ.Pe-GⅡ.4 Sydney 2012 genotype were likely to suffer from vomiting than those positive for NoV of GⅡ.P12-GⅡ.3 genotype.n Conclusions:NoV was an important pathogen causing acute gastroenteritis in children. GⅡ.Pe-GⅡ.4 Sydney 2012 and GⅡ.P12-GⅡ.3 were the major genotypes of NoV in hospitalized children with sporadic acute gastroenteritis in Tianjin in 2019.
其他文献
本文使用基于拉格朗日方法的后向轨迹模式(HYSPLIT)模拟了三峡大坝蓄水前后典型暴雨个例的气块运动轨迹,通过气块后向追踪分析法得到了三峡库区蓄水前后几次极端天气的水汽源
如果说2003年的可录式MD突出的是技术,那么对于这一年新开发的单放MD来说更强调的是外貌。放眼2003年新上市的单放MD机只能用乱花渐欲迷人眼来形容,平均20天左右的时间便有一
受1307号强台风“苏力”外围影响,2013年7月12日到14日黄岩大部分地区出现了暴雨到大暴雨,局部特大暴雨天气过程;并出现了10级、局部11级内陆大风,本文利用常规资料、对环流
全球气候变暖条件下,全球热带气旋、登陆中国的热带气旋发生了较明显的变化,而且超强台风增加趋势也很明显,但是学者们经过研究之后得出的结论并不尽相同.本文针对该问题,统
今年8月29日,《解放日报》有一篇报道说:芜湖市油墨厂三十多岁的王姓女工,在二年多前不慎头部撞上一根钢管,从此患上了饥饿病,无时无刻不感到饥肠辘辘,必须不停地进食。每天
位于忠州新城区的罗家桥,1993年9月开工,1995年3月竣工(见照片)。经过一年多时间重车行驶,全桥性能良好,达到预计效果。对于罗家桥的设计,由于桥址近区盛产石料,并考虑与城
1 张开大口打哈欠:深呼吸,吸进氧气,吐出二氧化碳,有助于脑细胞重新活跃起来。打哈欠后再施以头部按摩,效果会更佳。 1 open mouth yawn: take a deep breath, inhale oxyg
近年来,雷击伤人事故的案例频繁的通过网络、报纸、电视等媒体的报道进入大众的视线.有个别案例引起来人们的警觉,其中之一就是人们在室外露天场所用手机打电话时遭受雷击的
利用雷达以及地面观测实况资料对2012年4月2日影响浙北、浙中地区的大风强对流天气进行中尺度分析,结果表明:从中尺度物理场来看,是低层或地面强上升气流主导形成的汇合线,而
文章利用2010年11月-2013年3月舟山东沙和朱家尖围塘水温监测站资料以及2011年11月-2013年3月台门深水网箱养殖场海温监测资料,分析了两种海水养殖场水温概况以及水温的月际