【摘 要】
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Objective:To establish a novel approach for quick and highly efficient verification of human gene imprinting. Methods: A pair of dye-labelled probes, 5 nuclease
【机 构】
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Department of Infectious Diseases,National Institutes of Health,Eastern Hepatobiliary Hospital
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Objective:To establish a novel approach for quick and highly efficient verification of human gene imprinting. Methods: A pair of dye-labelled probes, 5 nuclease assay was combined with RT-PCR to determine the genotype of a transcribed single nucleotide polymorphism (SNP) rs705 (C＞T) of a known imprinted gene, small nuclear ribonucleotide protein N (SNRPN), on both genomic DNA and cDNA of human lymphoblast cell lines. Results: Allele discrimination showed a clear monoallelic expression pattern of SNRPN,which was confirmed by RT-PCR based restriction fragment length polymorphism (RFLPs). Pedigree analysis verified the paternal origin of expressed allele, which was in consistency with previous report. Conclusion: Transcribed SNP is an ideal marker for detecting gene imprinting by 5 nuclease assay. This approach also may be used to discover differential allele expression of non-imprinted genes, finding out gene cis-acting functional polymorphism.
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