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目的：分析医疗联合体内基本药物配备和使用的影响因素。方法收集2011—2012年辽宁省医联体改革试点城市两所三级医院基本药物配备和使用的基础数据，对比医联体医院改革前后基本药物在品种、品规、平均价格、销售金额、生产和配送数量等方面的变化情况。结果基本药物配备使用的品种数占医院药品总量的比例均有所提高，但与非基本药物依然存在巨大差距；品规数均有所上升；平均价格均远低于非基本药物；基本药物销售占比与国家要求仍存在较大差距；基本药物生产配送企业数量远低于非基本药物生产配送企业数量。结论基本药物配备和使用率总体上呈递增趋势，具有显著的价格优势。基本药物目录、药品招标采购和生产企业市场集中度等成为影响医疗联合体配备使用基本药物的最主要影响因素。