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随着计算机以及以其为核心的信息技术的快速发展，在很多领域都得到了广泛的使用。当前事业单位会计普遍实现了电算化，给会计工作带来了巨大的改变，极大的提高了会计工作的效率和质量。但是由于我国事业单位的会计电算化起步时间相对比较晚，因此在电算化的日常应用当中还存在很多的问题。文章对我国事业单位会计电算化中存在的问题进行了分析，就如何解决事业单位会计电算化应用中存在的问题进行了探讨。