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湖泊沉积中的生物标志物可以提供丰富的信息，包括有机物来源、沉积过程的古环境条件等。湖泊沉积主要反映区域气候变迁史，可以揭示短至十年尺度的古气候事件，是高分辨率古环境、古气候重建的理想材料。与其他湖泊古气候古环境代用指标相比，生物标志物在湖泊古生态系统恢复与古生产率评估、古大气CO2分压与古温度确定等方面可以提供更为精细的信息，成为研究湖泊环境的有力工具。评述了湖泊沉积生物标志物在湖泊环境变化中的研究现状及应用前景。