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应用了一种新的预测酶－配体复合物亲和性的方法来研究凝血酶抑制的结构－活性关系。凝血酶－抑制剂复合物的三维结构模板化合物的晶体结构进行搭建，然后使用程序ＳＣＯＲＥ计算复合物的亲和性。共分析了３个系列３４个抑制剂分子。计算所得的复合物的解离常数与实验值吻合得很好，大大优于用分子力学所给出的结果。通过比较其中两个抑制分子的结构和活性，说明了此方法能够定量给出配体分子中每个原子对结合过程的贡献大小，给出十