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泥蚶（Tegillarca granosa）基因组SSR和EST-SSR的开发及比较研究

来源 :海洋与湖沼 | 被引量 : 0次 | 上传用户：huanying19870604
【摘 要】
：
采用SSRHunter软件在泥蚶（Tegillarcagranosa）磁珠富集文库和454转录组文库中搜索核心序列长度12bp以上的2—6核苷酸重复序列，根据富集文库所得基因组SSR侧翼序列设计47对引物，可
【作 者】
：
周小龙 朱靖华 董迎辉 林志华 富凯立 姚韩韩 齐晓艳 
【机 构】
：
上海海洋大学水产与生命学院,浙江万里学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室,宁波大学海洋学院
【出 处】
：
海洋与湖沼
【发表日期】
：
2013年2期
【关键词】
：
泥蚶 基因组SSR EST-SSR Tegillarcagranosa  genomic-SSR  EST-SSR 
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采用SSRHunter软件在泥蚶（Tegillarcagranosa）磁珠富集文库和454转录组文库中搜索核心序列长度12bp以上的2—6核苷酸重复序列，根据富集文库所得基因组SSR侧翼序列设计47对引物，可成功扩增17对且均为多态性引物，多态率100％，平均等位基因数（Na）、观测杂合度（Ho）、期望杂合度（He）、多态性信息含量（PIC）分别为6．8、0．468、0．785、0．733。11344条EST序列中得到1683个SSR位点，检出率14．83％，平均每3．85kb出现1个位点。根据部分EST
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