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对一种基于RSA算法的注册码软件加密保护方案进行了分析，指出了原有方案中存在单纯考虑算法安全强度、忽略软件完整性检验和验证程序代码缺少安全保护等脆弱性问题，并针对这些安全隐患和本文需要保护的特殊软件，提出了一种基于USB Key的注册码软件保护方案。借助USB Key电子钥匙，完整性技术和保护函数对软件进行保护，提高软件保护的安全性。最后对软件保护方案的关键模块进行了设计和实现，并经过实验测试验证了设计方案的合理性和有效性。