基于GEO数据挖掘探讨扩张型心肌病发病机制

来源 :山西医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Jesses41
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的 对扩张型心肌病(dilated cardiomyopathy, DCM)进行生物信息学分析,探讨其发病机制并筛选出与病因学相关的核心基因。方法 使用R语言对来自基因表达综合数据库(gene expression omnibus, GEO)的DCM芯片数据进行差异分析,通过STRING数据库和CytoHubba来构建蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络及鉴定核心(hub)基因。采用DAVID6.8及R语言对差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)及核心基因进行基因本体论(gene ontology, GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)通路富集分析。利用比较毒理基因组学数据库(comparative toxicogenomics database, CTD)分析核心基因与DCM和心衰风险之间的关系。结果 784个DEGs具有统计学意义,其中上调541个,下调243个。DEGs主要富集于细胞外结构及基质的组成、免疫细胞迁移及活化和黏多糖的结合等多个GO子集中。DEGs显著富集于细胞因子-细胞因子受体相互作用、吞噬体、肾素-血管紧张素系统、细胞外基质受体相互作用、自然杀伤细胞介导的细胞毒性、细胞黏附分子和Th17细胞分化等信号通路中。构建的PPI网络中,鉴定核心基因为:FCGR3A、CD27、CD2、GZMB、PRF1、CCR7、CD247、SELL、TBX21、FCGR3B、ITGAL、LCK、IL10、IL2RB、CD38、CD40LG、CD5、CD3E、KLRB1和ZAP70。核心基因主要富集于白细胞黏附、免疫细胞活化调节、自然杀伤细胞介导的细胞毒性、Th1/Th2/Th17细胞分化、T细胞受体信号通路、病毒性心肌炎、细胞黏附分子、细胞因子-细胞因子受体相互作用和NF-kappa B信号通路等。CTD数据库分析提示核心基因IL10、CD38、SELL、LCK、CD27、GZMB、TBX21、ZAP70、CD5、CD3E和CD2同时与DCM及心衰关联紧密。结论 炎症及免疫反应在DCM的发病机制中发挥重要作用,核心基因IL10、CD38、SELL、LCK、CD27、GZMB、TBX21、ZAP70、CD5、CD3E和CD2与DCM发生发展密切相关。
其他文献
不礼貌言语是导致"煤气灯效应"产生的一个重要因素。本文以多个典型煤气灯效应案例中记录的话语为语料,分析其中不礼貌话语策略的使用情况。基于Culpepper的不礼貌框架,对煤气灯操纵者不礼貌策略的实现形式进行分析,发现其使用可以实现削弱他人内控信念和掌握关系权力的语用功能。
<正>2022年1月6日,平安证券联合平安银行在深圳举办“平安绿色金融助力高质量发展白皮书(2022)发布暨研讨会”,发布银行业首部绿色金融白皮书。政府、高校、企业与金融机构代表线上线下共聚一堂,共商绿色金融助力实现“双碳”目标的发展路径,支持实体经济绿色、可持续发展。此次白皮书的发布,是平安证券近年来持续发挥专业优势、深化科技赋能、助力绿色金融高质量发展的一个缩影。平安证券以绿色金融项目为牵引,
期刊
目的 探讨绿色通道联合个体化预警评估护理在小儿高热惊厥中的应用效果。方法 回顾性选择2020年2月至2022年2月浙江大学医学院附属第二医院临平院区儿科收治的小儿高热惊厥患儿100例,采用随机数字表法将其分为对照组和干预组,每组各50例;对照组患儿予常规急救护理,干预组患儿予绿色通道联合个体化预警评估护理,比较两组患儿的症状控制效果、急救及康复指标和治疗依从性。结果 护理后,干预组患儿的抽搐消失时
近年来,地铁作为解决城区交通问题的重要途径在国内掀起了大规模的建设热潮。我国有三十八个城市已开通地铁运营,其中历史文化名城的有二十四座,其中有大量和历史街区联系紧密的地铁站。西安是我国著名历史古城,城区内有三片历史文化街区,北院门作为其中范围最广、影响力最大的历史街区,周边地铁建设在不断推进;但北院门地铁站点建设并未充分考虑出入口与周边历史街区的联系,出现了交通集散混乱、风貌不协调等问题。随着游客
目的 探讨对小儿高热惊厥患儿实施苯巴比妥联合地西泮治疗的临床价值,为小儿高热惊厥患儿的临床治疗提供帮助。方法 选择2018年2月—2020年6月高唐县人民医院收治的130例小儿高热惊厥患儿,遵从“平衡序贯法”分为对照组63例和观察组67例,对照组给予苯巴比妥单一用药,观察组给予苯巴比妥联合地西泮治疗。观察两组临床疗效、临床各指标用时、血清指标以及免疫功能改善情况。结果 观察组临床总有效率为97.0
<正>钩藤为茜草科植物钩藤Uncaria rhynchophylla (Miq.) Miq.ex Havil.、大叶钩藤U.macrophylla Wall.、毛钩藤U.hirsuta Havil.、华钩藤U.sinensis (Oliv.) Havil.或无柄果钩藤U.sesslifrudus Roxb.的干燥带钩茎枝。秋、冬二季采收,去叶,切段,晒干。具有息风定惊、清热平肝之功效。用于肝风内动
期刊
迈克尔·契诃夫(Michael Chekhov,1891-1955年)是20世纪最为独特的演员和表演教师之一。从1913年在莫斯科艺术剧院实验性的第一工作室的初次职业演出开始,到42年后在好莱坞去世,契诃夫先后震惊了俄语、德语、法语和英语世界的观众。斯坦尼斯拉夫斯基每每提及契诃夫——这个较为激进的斯坦尼斯拉夫斯基现代表演体系的挑战者,都称其为"我最为杰出的学生"。文章指出,迈克尔·契诃夫的方法是一
“五育并举,德育为首”是目前素质教育发展的基本要务,这对新时期的班级管理工作也提出了新要求,赋予了初中班主任新的管理责任。基于此,本文立足新时期的“五育并举”教育理念,结合初中班级管理实践工作,阐述分析了基于五育并举理念下的班级管理工作应如何有效开展,以期推动素质教育的进一步发展落实。
<正>亲爱的小童迷们:考察你们常识积累的时间到啦!请问,有“美国的《西游记》”之称的童话故事集叫什么?没错,它就是著名的《奥兹国所险记》。《奥兹国历险记》有一个更加动听的别名,叫《绿野仙踪》。故事围绕着奥兹国的历史,由奥兹国的魔法师开始,叙述了一个个精彩而又引人入胜的故事。住在大草原上的小女孩多萝茜,因为一次龙卷风突袭,被卷入一个陌生而神奇的国度,好心肠的女巫告诉她,只有奥兹国的大魔法师奥兹才能送
期刊
<正>哈尔滨新区第一学校是一所标准高、配备精、理念新的九年一贯制公办学校。自2019年办学以来,学校坚持依法治校,依法执教,围绕“治理结构、建章立制、决策监督、师生权益”四方面发力,改革创新,加强青少年法治教育,全力推进教育治理体系和治理能力现代化。
期刊