普通的胃肠炎、阑尾炎，或是一过性的肠痉挛，无需进行医学影像学检查。而长期腹部隐痛，或是剧烈的腹痛，甚至伴有血尿、休克等，就需要做医学影像学检查。腹痛所涉及的器官较多，有消化系统、泌尿系统、生殖系统等，仅消化系统在腹部的就有肝、胆、胰、肠等。因此，腹部检查将涉及到所有的影像学。
　　外伤　由外伤所引起的腹痛，少不了要做超声检查，看看是否有肝脾破裂，有否腹腔积液和肾脏问题。其次做CT检查，以证实上述情况的存在。如果考虑有肠穿孔的可能，还得进行站立位的腹部x线平片检查，看看膈下是否有一轮“弯弯的月亮”，以考虑膈下游离气体的存在。如果外伤伤及尿道，还得做尿道的X线造影，以明确尿道受伤狭窄情况。
　　胃肠道检查　如果病人常常在饭前或饭后腹痛，应考虑胃或十二指肠球部溃疡的可能性，通常要做上消化道钡餐检查。如果发现溃疡，考虑其癌变，或是直接发现肿瘤，则需做CT平扫加增强，以明确肿瘤与其周边的关系，是否有远处转移。如果是下消化道的肿瘤，需要做钡剂灌肠，以及CT检查。如果是小孩肠扭转，以及怀疑手术后或是肿瘤占位引起的肠梗阻，需要做站立位的腹部X线平片检查。如果是肿瘤引起的肠梗阻，还得做CT平扫加增强，寻找肿瘤所在位置。
　　消化腺检查　如果是肝脏的问题，少不了要做超声检查。一旦发现问题，特别是区分肝囊肿、肝血管瘤以及肝肿瘤时，离不开CT的平扫加增强，以及CT的延时扫描，甚至需要做磁共振帮助诊断。如果确诊为肿瘤，还要进行大范围的CT平扫加增强，看看是否有远处转移。如果上腹部疼痛是因为胆囊引起，同样也离不开超声检查，看看是否有胆囊结石，或是胆囊肿瘤。前者仅需做CT平扫，有时考虑阴性结石，需进行磁共振的胰胆管成像；后者需要在CT平扫的基础上进行CT增强扫描。如果是暴饮暴食所引起的腹痛，考虑有胰腺炎的可能时，需进行CT扫描。如果有考虑胰头癌的可能性时，除了CT平扫加增强外，还要进行超声检查，以及上消化道钡餐检查。
　　泌尿系统检查　如果腹痛是因为泌尿系统结石所引起，就得做腹部超声检查、X线平片检查。倘若考虑阴性结石存在，或是要看看肾脏泌尿功能的情况，则需要进一步行泌尿系统的X线造影检查；如果X线造影显示不佳，还得进行逆行性尿路造影，有时需要做CT平扫。如果考虑肿瘤、结核，或是囊肿、多囊肾，以及泌尿系统畸形时，除了超声和泌尿系统的X线造影外，还得做CT平扫加增强及三维重建。如果是膀胱结石，需要做膀胱X线平片检查，甚至是膀胱造影。如果是膀胱癌、膀胱结核，需要做X线膀胱造影检查，以及CT的平扫加增强，甚至是磁共振检查。
　　生殖系统检查 前列腺检查离不开超声检查、磁共振检查；如果是癌症，还得考虑大范围的CT平扫加增强，以明确受累范围；若考虑有骨转移的可能，还得进行核医学检查。育龄妇女有性生活史、腹痛，甚至出现休克症状时，就得考虑有宫外孕的可能性，此时少不了超声检查。附件肿瘤要做CT平扫加增强，以及磁共振检查。