基于线粒体nad1 intron2序列的金钗石斛和混淆品亲缘关系及DNA条形码研究

来源 :江苏农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：CL87781891

【摘要】

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为了建立简便、重复性高的金钗石斛的分子鉴别方法,对金钗石斛及其混淆品的亲缘关系进行分析并构建稳定的序列条形码分析,根据金钗石斛及其混淆品的nad1intron2序列,寻找其中

【作者】

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丁鸽张代臻丁小余蔡照胜商士斌

【机构】

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盐城工学院化学化工学院,南京师范大学生命科学学院,江苏省滩涂生物资源与环境保护重点建设实验室,中国林业科学研究院林产化学工业研究所

【出处】

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江苏农业科学

【发表日期】

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2018年21期

【关键词】

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金钗石斛 nad1基因第2内含子单核苷酸多态性亲缘关系 DNA条形码

【基金项目】

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国家自然科学基金(编号:21606192),江苏省自然科学基金(编号:BK20171276),国家重点研发计划(编号:2016YFD0600800)

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为了建立简便、重复性高的金钗石斛的分子鉴别方法,对金钗石斛及其混淆品的亲缘关系进行分析并构建稳定的序列条形码分析,根据金钗石斛及其混淆品的nad1intron2序列,寻找其中存在的特异性位点并设计特异性鉴别引物,运用Mega5.0等软件进行遗传关系分析并构建系统进化树。根据序列中存在的单核苷酸多态性(SNP)位点及特异性鉴别引物,可在53℃的复性条件下扩增得到约400bp的条带,将金钗石斛与其混淆品成功分开;构建的UPGMA树可以将金钗石斛及其混淆品鉴别开。SNP位点及位点特异性PCR具有高效、准确、省时

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