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聚类方法是面向基因数据库知识发现的主要手段之一.随着后基因时代的到来,巨量的基因数据向现有的聚类分析方法提出了严峻的挑战.就基因数据库知识发现的内容、聚类方法在基因数据分析中的应用和基因数据库的特征进行了分析与探讨,指出面向基因数据分析的聚类方法必须解决基因数据集巨量性、异构性、高维性等6个固有特征所产生的一系列问题.