猪圆环病毒2型10JS-2株的分离与全基因组序列分析

来源 :中国畜牧兽医 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yty3224
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本试验从江苏某猪场采集猪血清,进行猪圆环病毒2型(PCV2)的检测和分离,根据GenBank中登录的PCV2全基因组序列,设计1对特异性引物,扩增PCV2全基因组,并且进行序列测定和分析。发现一株PCV2 10JS-2的基因组全长为1779nt,在病毒复制起始区域含有11个碱基的插入。在GenBank中对含有11个碱基插入的毒株序列进行BLAST发现,有两株PCV2(AY321993和EF565360)也有11个碱基的插入,但是与10JS-2比较,插入的碱基和插入的位置不同。遗传进化分析显示10JS-2属于PCV2a基因型,AY321993和EF565360属于PCV2b基因型,因此推断10JS-2可能是由PCV2a基因型的毒株在复制起始区域发生碱基插入形成的。这是首次发现此类PCV2毒株。
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