α-螺旋跨膜蛋白结构预测的研究进展

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在基因组数据中,有20%~30%的产物被预测为跨膜蛋白,但由于实验测定的困难,在PDB数据库中只有1%左右的跨膜蛋白结构。跨膜蛋白结构的缺乏,以及跨膜蛋白重要的生理功能,使得通过计算生物学的方法来获得新的结构显得尤为重要。这些方法主要涉及的内容有:膜蛋白跨膜片段和拓扑结构的预测分析,同源模建,从头预测等。在对前者的预测中,目前的预测方法都具有很好的预测精度,主要难点集中在后两者中。文章综述了近些年来跨膜蛋白结构预测的研究进展,并对目前流行的方法进行了介绍。
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