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2006年，甘肃出生缺陷总发生率为119.44/万，其中城市89.76/万，农村164.99/万，男孩103.75/万，女孩133.63/万。据估算，该省每年有2800名出生缺陷患儿诞生。先天畸形发生顺位依次是神经管缺陷、总唇裂、先天性脑积水、多指（趾）和先天性心脏病，其中神经管缺陷的发病率一直明显高于全国水平，