自《行政事业单位内部控制规范》印发以来,各级行政事业单位都广泛开展了内控控制的建设和加强工作.科研事业单位作为行政事业单位中较为特殊的一类公益二类事业单位,其收入支出构成更为复杂,如何进一步完善科研事业单位的内控制度建设,加强收支债务管理,最大程度控制资金风险和舞弊现象,成为科研事业单位迫切需要解决的问题.本文从科研事业单位内部控制的基础理论出发,对科研事业单位内部控制管理中存在的问题和现状进行了剖析,如重要性认识不足、制度建设不健全、监督力度不足等.同时提出了相应的改善对策,一是加强培训力度,提升重视程度.二是完善制度建设,科学设计流程.三是明确收支范围,加强审批力度.四是重视分析研判,编制分析报告.最终结合提出建议,提出了合理的内部控制信息化建设的方案参考.本文的价值在于使科研事业单位了解其内部控制存在的问题,建设的重难点与具体的实施方案,对科研事业单位内控信息化建设的推进有一定的参考价值.