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以药用植物贯叶金丝桃为研究对象，对其ISSR—PCR反应体系中模板DNA用量、Mg2＋浓度、dNTP浓度、Taq酶含量及退火温度等因素进行了梯度试验，得到最佳ISSR—PCR反应体系，并初步筛选出13条条带清晰、多态性高、重复性好的ISSR引物，为贯叶金丝桃遗传多样性及种质资源鉴定等方面的研究奠定基础。