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从棉花BAC序列中鉴定了1个Ty1—copia类逆转座子，根据RNAseH—LTR连接区序列信息设计了特异引物，通过优化试验条件建立了一套经济、高效的SSAP（Sequence—specificamplificationpolymorphism）标记体系。分析棉属不同种的SSAP发现，SSAP在棉属不同种中均有丰富的扩增位点，而且棉花中SSAP多态性位点远高于AFLP（Fragmentlengthpolymorphicmarkers）。这一标记系统可增加棉花染色体端粒区域的标记密度，促进棉花高密度遗传图谱