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运用数据包络分析法（DEA）和因子分析法分别评价了我国各个省市跨国公司R＆D投资影响力和区域创新系统演化程度,得出了跨国公司R＆D投资与区域创新系统演化程度存在正线性关系的结论。根据这一结论和因子分析结果,从投入产出角度建立了线性回归模型分析跨国公司R＆D投资对区域创新系统演化程度的影响,并且得出结论：跨国公司R＆D投资是推动区域创新系统演化重要的投入因素;其他R＆D投资对区域创新系统的演化起到了一定的辅助作用。