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蛋白质相互作用在生命活动中起着核心作用，蛋白质复合体亚基的结合是蛋白质相互作用的一种重要形式．由于实验方法耗时耗力，因此从理论上预测蛋白质相互作用有着特殊的意义．首先对蛋白质复合体的结合区统计其二级结构、超二级结构和二级结构组合的频数，以及这些结构占整个蛋白质氨基酸链中各类统计数目的百分比，得到各类型结构出现在结合区的相对倾向值．而后，根据相对倾向值给出相结合的两个蛋白亚基的氨基酸链的打分规则．选取64个氨基酸长度为标准滑动窗口，以1为步长，将每一对蛋白链得到一组分值作为特征值输入支持向量机，构建模型．用