马铃薯StDRO2基因的生物信息学分析

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【目的】根系构型对植物生长发育起到重要作用,DEEPER ROOTING1(DRO1)基因参与调控植物根生长角度。但是马铃薯DRO1同源基因的生物学信息还不清楚。【方法】本研究利用生物信息学软件分析了马铃薯中StDRO2蛋白的理化性质、亚细胞定位、保守结构域、系统发育树及蛋白质结构。【结果】发现马铃薯StDRO2基因编码亲水性不稳定蛋白,定位在细胞核,氨基酸序列具有IGT基因家族典型结构域。蛋白质二级结构预测显示StDRO2蛋白质均具有无规则卷曲、α-螺旋、β-转角和延伸链结构。通过实时定量PCR分析,马
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