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病毒性眼病的药物治疗取得了很大发展，由非选择性抗病毒药物如碘苷、三氟胸腺嘧啶核苷发展到选择性抗病毒药物，包括阿昔洛韦、更昔洛韦、伐昔洛韦、喷昔洛韦、泛昔洛韦等。此外，干扰素（IFN）、白介素（IL）能增强免疫应答，是有效的辅助药物。基因工程疫苗和抗病毒特异性抗体导向治疗显示了一定的临床应用前景。