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以（吴旗黄芥x武功芥菜）F2代群体为材料，在前期研究基础上利用拟南芥、芸薹属基因组上已知的序列信息，发展与陕北黄芥粒色基因紧密连锁更近的内含子多态性（Intron Polymorphism，IP）标记。研究表明，在陕北黄芥黄籽基因与拟南芥基因组3号染色体的同源区域At3g14120～At3g29615内设计4对引物，发现At3g23030处的IP标记与黄籽基因连锁。将前期黄籽基因遗传连锁图谱上一个最近的AFLP标记EA02MC08侧翼序列利用PCR—walking技术延长，经BLAST分析将该标记成功定位