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首次建立并优化了菲律宾蛤仔Ruditapes philippinarumSRAP分子标记技术体系,并利用17对引物组合对经过连续选育的白蛤、橙蛤和墨蛤3个菲律宾蛤仔品系进行了分子标记分析。结果表明:3个品系蛤仔共扩增出510个位点,白蛤品系的Nei指数和Shannon指数均显著高于墨蛤和橙蛤品系(P〈0.05);遗传分化指数(白t)为0.0001~0.6448,平均为0.0467,表明有4.67%的变异存在于群体间,95.33%的变异存在于群体内;基因流(Nm)为0.2754—2000,平均每个位点的Nm