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早在1973年Belliveau提出了呼吸道正常菌群与病原菌感染的关系后，呼吸道微生态便成为了研究者关注的焦点。正常菌群作为一种抗原刺激宿主产生抗体，刺激巨噬细胞和其它清除机制，增加干扰素活性，并通过释放脂肪酸等毒性终末代谢产物等构成防止外来细菌侵入的生物屏障。在自然和人工因素影响下，这些正常菌群无时无刻都在进行着各种演替，这一过程使得呼吸系统微生态形成了动态平衡。