肺腺癌组织lncRNA FAM83A-AS1表达及临床意义数据库分析

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目的 肺癌是全球发病率和死亡率最高的恶性肿瘤.长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)广泛参与了肿瘤的发生、进展和转移等过程.本研究利用癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)公共数据集分析IncRNA FAM83A-AS1在肺腺癌中的表达及临床意义.方法 从TCGA中下栽2020年2月前517例肺腺癌组织与59例癌旁组织RNA的测序数据及对应的患者临床资料,探讨FAM83A-AS1表达水平与临床病理特征的相关性及其对肺腺癌的诊断意义.采用Kaplan-Meier法和Cox比例风险回归模型进行生存分析探讨影响肺腺癌患者预后的因素.预测筛选肺腺癌中FAM83A-AS1相关的mRNA,通过String和CytoScape软件构建蛋白质相互作用(protein & protein interaction,PPI)网络并进行基因本体论(gene ontology,GO)分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析.结果 肺腺癌组织中FAM83A-AS1表达水平明显高于癌旁组织(P<O.001).FAM83A-AS1高表达与年龄(x2=5.814,P=0.020)、肿瘤晚期(x2=9.336,P=0.003)、淋巴结远处转移(x2=10.685,P=0.001)和吸烟(x2=11.859,P=0.001)有关.FAM83A-AS1的表达水平用于鉴别肺腺癌组织与正常肺组织,其ROC曲线下面积为0.969 4.生存分析结果显示,FAM83A-AS1高表达患者总体生存率(overall survival,OS)较低(x2=10.660,P=O.001),无复发生存率(recurrence free survival,RFS)较低(x2=6.171,P=0.013).Cox多因素回归分析结果显示,FAM83A-AS1高表达是影响OS(HR=1.681,95%CI为 1.112~2.539,P=O.O14)和RFS(HR=1.510,95%CI为1.093~2.086,P=0.012)的独立预后危险因素.GO和KEGG分析结果表明,FAM83A-AS1可能富集在细胞形成、细胞黏附迁徙、神经元生成分化等功能以及MAPK信号通路、肿瘤通路、轴突导向、胰岛素信号通路和Wnt信号通路中.结论 FAM83A-AS1可能参与肺腺癌的发生,提示FAM83A-AS1可能是肺腺癌的潜在治疗靶点,并具有作为肺腺癌患者的诊断及预后标志物的潜能.
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