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微生物参与下的氮循环是富营养化湖泊十分重要的生物地球化学循环过程.采用基于amoA功能基因和16S rRNA基因的荧光定量PCR、PCR-DGGE与高通量测序等分子生物学技术，调查秋季太湖不同水体和表层沉积物中氨氧化古菌（AOA）、氨氧化细菌（AOB）和亚硝酸盐氧化菌（NOB）群落丰度和组成，探讨影响硝化微生物分布的关键环境因子.结果表明，中度富营养化的梅梁湾湖区水体表层、中层和底层水样和表层底泥中AOA amoA基因的丰度分别低于轻度富营养化的湖心区，而不同层水样中AOB amoA基因的丰度分别高于湖心